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Colby T. Ford 提交于 2024-05-14 21:22 . Add Dockerfile (PyTorch base image)
FROM pytorch/pytorch:2.3.0-cuda12.1-cudnn8-runtime
## Add System Dependencies
RUN apt-get update \
&& DEBIAN_FRONTEND=noninteractive apt-get install --no-install-recommends -y \
build-essential \
git \
wget \
&& rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
&& apt-get autoremove -y \
&& apt-get clean
## Change working directory
RUN mkdir -p /app/alphafold
WORKDIR /app/alphafold
## Install the AlphaFold3 package + requirements
COPY . .
RUN python -m pip install -r requirements.txt \
&& python -m pip install git+https://github.com/aqlaboratory/openfold \
&& python -m pip install .
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